Mikroorganizmat si kërpudhat dhe bakteret mund të rriten në karburantin dizel dhe përhapja e tyre mund të bllokojë filtrat e karburantit dhe të dëmtojë motorët.
Teorikisht, probleme mund të shfaqen edhe në motorët me benzinë me një përzierje të lartë të biokarburanteve E10, E85 ose E100. Megjithatë, Klubi Gjerman i Automobilave (ADAC) shpjegon se kjo nuk ndodh shpesh në motorët e makinave.
Nafta në to konsumohet vazhdimisht dhe rrallëherë qëndron në rezervuar për një kohë të gjatë, kurse në kampe, veçanërisht në varka dhe mjete bujqësore, rreziku nga dëmtuesit e naftës është më i madh sepse mjetet e përmendura transportuese dhe makinat nuk përdoren për një kohë të gjatë. Veturat që kanë qëndruar ulur për një kohë të gjatë janë gjithashtu në rrezik më të madh sepse mikroorganizmat më pas kanë një shans të rriten dhe të riprodhohen.
Benzina dhe nafta kanë një origjinë organike, dhe shtimi i një sasie më të madhe të biokarburantit rrit përqindjen e lëndës organike në karburantin dizel dhe siguron kushte më të mira jetese për mikroorganizmat, bakteret dhe kërpudhat. Kur këta organizma rriten, formohet biollum që mund të shkaktojë bllokime në filtrat e karburantit.
Një nga metodat më efektive të parandalimit është zëvendësimi ose konsumimi në kohë i bionaftës.
Ruajtja afatgjate e karburantit mbështet ndjeshëm përhapjen e mikroorganizmave, kështu që bionaftë duhet të përdoret ose të zëvendësohet më së voni pas gjashtë muajsh.
Disa pronarë do t’i mbushin rezervuarët para ruajtjes dimërore të automjeteve të tyre për të parandaluar kondensimin e ujit, pasi bakteret lulëzojnë në ujë. Sidoqoftë, karburanti dizel tashmë përmban ujë – sipas normës së BE-së, EN 590 deri në 200 miligramë për kilogram karburant, dhe bionaftë përmban deri në 500 miligramë.
Uji gjithashtu hyn në rezervuar përmes kanaleve të ventilimit. Nëse temperaturat rriten në pranverë ose kampi ose varka juaj është në një dhomë të nxehtë, rezervuari bëhet një terren mbarështues për bakteret dhe kështu dëmtuesit e naftës, sipas ADAC. Nëse nuk e përdorni automjetin për një kohë të gjatë, është më mirë ta zbrazni plotësisht rezervuarin.